Τις νομιμα αγορασμένες όχι, εννοείται πως δε τις χάνεις, απλά τις ξαναπερνάς μέσω iTunes..
Γενικά πρέπει να γίνει καθαρό Restore->Set Up As New διότι αν επαναφέρεις το Backup που χεις τωρα με το Jailbreak πιθανόν να σου αφήσει "σκουπίδια" τα οποία δε θα μπορείς να τα βρείς που υπάρχουν εύκολα, οπότε αναγκαστκά αυτό πρέπει να κάνεις.